Após uma sofrida e intensa luta contra o D-Reaper em plena cidade de Shinjuku, Takato, Lee e Ruki com seus parceiros Guilmon, Terriermon e Renamon, conseguiram vencer e trazer de volta a paz entre os dois mundos. Mas, por efeito colateral a eliminação do D-Reaper, os digimons regrediram em sua evolução, precisando se despedirem e retornar ao digimundo. O mal havia sido derrotado e a lembrança de seus amigos digitais viverá para sempre com eles. Entretanto… Takato, em uma das muitas tardes que reservava para brincar no parque, viu um tipo de portal ou passagem para o digimundo na cabana onde abrigava seu amigo Digimon. O que isso significa? Estaria mesmo o digimundo e o mundo real a salvo definitivamente?